胃肠肿瘤中心四病区专业方向是胃癌、结直肠癌等外科。在开展传统开腹手术的同时采用更加先进的腹腔镜微创技术进行胃肠肿瘤标准化手术。全国个肿瘤专科医院建立的以腹腔镜微创为特色的科室。年均完成胃肠肿瘤腹腔镜手术居中国北方地区首位。代表着我国北方地区腹腔镜微创的水平，在全国处于地位。
科室主任苏向前教授，主任医师，博士生导师，曾留学美国加州大学医学中心(UCLA);现任北京大学肿瘤医院副院长，;担任中国医师协会结直肠外科委员会副主任委员，中国协会胃癌专业委员会委员等十余个学术组织兼职。科室另有副主任医师2名，副研究员1名，主治医师4名，住院医师3名，助理研 究员2名，均拥有博士学历。
科室承担了多项、省部级科研项目。在临床研究方面，以胃肠肿瘤腹腔镜微创外科问题为中心，在北京市医院管理局临床技术创新项目、首都临床特色应用研究基金、首都医学发展科研基金资助下主持了多项研究课题。牵头并参与国内外相关临床试验(CLASSIC研究、RESOLVE研究等)。在基础研究方面围绕着胃肠肿瘤发生的分子机制，Nomogram肿瘤预测模型，胃肠肿瘤分子标志物的鉴定与临床意义等开展了一系列研究工作，相关研究工作获得国家自然科学基金项目资助。
作为在国内倡导并推广“胃肠道肿瘤腹腔镜微创手术规范化”，先后牵头成立了“中国北方肿瘤医院微创手术协作组 ”和“北方地区腹腔镜微创沙龙”等学术组织。做为我国北方地区规模的“腹腔镜胃肠道肿瘤微创培训基地”，在众多省份进行“胃肠道肿瘤腹腔镜微创规范化手术巡讲”，举办数十期“腹腔镜规范化手术学习班”，培养了200余名腹腔镜专业人才。
乳腺癌预防中心提供乳腺肿瘤诊断及方面的医疗服务。本中心于1998年在北京市重点学科专项资助下组建。2004年结构调整，成为具备乳腺肿瘤诊治功能的一级临床科室，功能涵盖乳腺癌筛查，乳腺病变的诊断，原发性乳腺癌、随访及康复指导，复发性乳腺癌，同时开展相关临床与基础研究。
2021年科室医生总人数30人，正高职称人数6人，副高职称人数8人，中级职称人数13人，初级师人数3人。按学历划分：博士21人，硕士4人，本科4人，专科1人。科室主任：欧阳涛，副主任：范照青、何英剑。护士长：于新颖、徐京燕、孙红娟。
本中心由门诊诊室4间、住院床位64张、门诊穿刺室、超声影像诊断室等部分组成。
“依据循证医学原则，结合研究成果，提供规范的、专业化的医疗服务，保障乳腺肿瘤的总体疗效”是“中心”的任务，“提供高品质的医疗服务，做出有指导意义的研究成果”是“中心”团队追求的目标。
消化肿瘤内科专注于胃肠道肿瘤的，以临床研究推进临床实践，以人才培养带动学科发展。专长于胃癌、结直肠癌、食管癌、胰腺癌、胃肠间质瘤、神经内分泌肿瘤、胆道肿瘤、肝癌等，以及难治性消化系统肿瘤的诊断与、综合及个体化。消化肿瘤内科拥有60多张病床，2013年接诊3万余人次。患者来自全国各地以及海外。科室专业技术实力雄厚，特别在胃癌、食管癌等中国高发肿瘤以及结直肠癌的，我们积累了丰富的经验，水平居于国内地位，病人在这里能享受到的医疗服务、的策略与方案。我们还为国内各大肿瘤专科医院培养了数百人的研究生及进修医生，推动了国内消化道肿瘤的规范化。同时我们基于临床问题开展的临床研究，以及牵头承担的数十项国家、省市级科研项目，提升了国内整个临床水平，促进了学科发展。
我院手术室是为患者提供手术的外科临床平台科室，是北京大学肿瘤医院打造国际化肿瘤专科医院的重要战略支撑。现有24个手术间，每年开展2万余台各类恶性肿瘤手术，包括胃癌、肺癌、乳腺癌、结直肠癌、食管癌、肝癌、腹膜后肿瘤、卵巢癌、胰腺癌、宫颈癌、前列腺癌、膀胱癌、肾癌、骨与软组织肿瘤、头颈肿瘤等各种常见及罕见的恶性肿瘤。依托于手术室先进设备及手术室护理团队多年经验，手术室护理团队可熟练配合各项肿瘤常规及复杂手术。团队在2D、3D、荧光腔镜、超声刀、Ligasure、ERBE等操作上具有丰富的临床经验;在术中超声设备、自体血回输设备、腹腔热灌注化疗设备、术中放疗、胸科磁导航设备、人工心肺机等配合使用上也富有经验。