北京大学肿瘤医院肝胆胰外一科创建于1996年。现有病床33张，医师10人，其中正高职称医生2人，副高职称1人，中级职称4人，在读研究生4人，所有医生均为研究生毕业。建科以来，在黄信孚及邢宝才主任的领导下，科室全体医师秉承以"延长病人生存，改善病人生活质量，为病人解除病痛"为目标，把肝胆胰肿瘤综合的理念与肝胆胰外科手术的近技术相结合，不断创新，不断提高，不断完善，形成了鲜明的本科室的诊疗特色。在医疗、科研和教学方面居国内水平。同时，培养出了一大批研究生和青年医师。
现任主任邢宝才，教授，主任医师。担任：中国协会肝癌专业委员会常委，中华外科学会肝脏外科学组委员，中华肿瘤学会肝癌学组委员，中国协会大肠癌肝转移学组委员，中国协会胆道肿瘤委员会常委，中国协会胰腺癌委员会委员，卫生部肿瘤规范化专家委员会委员，北京协会理事，北京协会肝胆胰肿瘤委员会主任委员，北京肿瘤学会委员，北京大学肝癌中心副主任，北方肝癌专家委员会副主任。同时担任多种杂志的编委和审稿专家。
乳腺肿瘤内科是以进展期乳腺癌诊治为主的专科临床科室，现有主任医师3名，副主任医师1名，主治医师5名，住院医师2名，临床护士20名，开放床位33张。科室以乳腺癌综合为重点，包括化疗、内分泌、靶向等，强调规范化基础上的个体化，尤其对于复发转移性乳腺癌的更有丰富的经验和独到的见解，诊治水平在国内享有盛誉，是NCCN乳腺癌指南中国版内科部分执笔人之一，主持和参与多项国内外临床试验。乳腺肿瘤内科近5年主持或参与完成了多项国家自然科学基金、国家973项目分课题、北京市新世纪百千万人才工程、首都医学发展科研基金、教育部高等学校博士学科点专项科研基金、北京市卫生系统高层次人才培养计划、国家“十二五”重大专项课题。发表文章百余篇，其中SCI文章三十余篇。
北京肿瘤医院中西医结合科暨老年肿瘤科以中西医结合，肿瘤为特 点。在肿瘤的不同阶段，如放化疗期间、化疗间歇期、术后或系统后。根据不同原则，进行中医施治，发挥中西医优势互补的作用。在肿瘤的综合中，注意发挥祖国医学特色，注意调整与机体全身状况的关系，争取在有效控制肿瘤的前提下，限度地减少患者的痛苦。
在临床实践中总结并制定了减 轻化疗副作用的协定。如保护肾功能方，保护肝功能方，以及不能口服药时减轻腹胀症状的外用药等，改善患者一般状况、提高免疫功能、增进食欲的协定 及保护骨髓造血功能方等，均取得了较好的疗效。科室还研制了外用药，化疗引起的血管损伤、皮肤肿痛及癌症引起浅表部位疼痛等，都收到了明显的疗效。中西医结合科暨老年肿瘤科已形成了一整套中西医结合方法和特色，受到患者欢迎
我院手术室是为患者提供手术的外科临床平台科室，是北京大学肿瘤医院打造国际化肿瘤专科医院的重要战略支撑。现有24个手术间，每年开展2万余台各类恶性肿瘤手术，包括胃癌、肺癌、乳腺癌、结直肠癌、食管癌、肝癌、腹膜后肿瘤、卵巢癌、胰腺癌、宫颈癌、前列腺癌、膀胱癌、肾癌、骨与软组织肿瘤、头颈肿瘤等各种常见及罕见的恶性肿瘤。依托于手术室先进设备及手术室护理团队多年经验，手术室护理团队可熟练配合各项肿瘤常规及复杂手术。团队在2D、3D、荧光腔镜、超声刀、Ligasure、ERBE等操作上具有丰富的临床经验;在术中超声设备、自体血回输设备、腹腔热灌注化疗设备、术中放疗、胸科磁导航设备、人工心肺机等配合使用上也富有经验。