燕窝中的主要营养成分是蛋白质，其中有1种必需氨基酸（赖氨酸），3种条件性必需氨基酸，而人体需要的必需氨基酸有8种，条件性必需氨基酸有13种。
燕窝的营养价值非常有限，性价比极低。如果平时食用适量的肉蛋奶，加适度海产品，就足以获取燕窝能提供的一切营养价值。美国普度大学农业与生物系食品工程专业博士云无心、中国第四军医大学营养与食品卫生教研室主任王枫均对记者表示，以蛋白质为例，燕窝就不如鸡蛋、牛奶“优质”。而从满足人体需求的角度来说，燕窝的氨基酸组成并不好，它所能提供的营养为不完全蛋白质，对人体的好处尚不如鸡蛋和牛奶。中国食品营养委员会主任姬黎霞也告诉《科技生活》周刊，现代的医药研究证实，燕窝含有蛋白质、微量元素及氨基酸。但是对于含有以上物质的食物，并不只是燕窝独有，一些平民化的食物中也能获得，“比如银耳、百合、山药等含有粘液的食物。”
洞燕是采摘于野外山洞、沿海峭壁的燕窝，这是原始的燕窝的存在形态。洞燕色灰色或黄色，羽毛及杂质较多，口感较为爽实。因早期的滥采，金丝燕生存环境遭到破坏，洞燕的产量逐年下降，洞燕出产量很低。随着环保呼声高涨，人们积极改变了金丝燕生存环境和燕窝采摘环境。随后，洞燕逐渐被屋燕取代。屋燕只是采摘的环境由山洞、峭壁变成了人工搭建、适合金丝燕筑巢的人工屋，而并没有改变金丝燕的生活习性。大自然的原始森林环境和人工屋技术的结合，有效解决了金丝燕保护和燕窝产量的矛盾，形成了独特的原生态屋燕，屋燕色较白，质松，毛少口感较滑软。如果燕子屋的卫生条件控制得好，屋燕窝会相对干净，色泽也较理想，而洞燕窝则可能会有较多的沙粒、泥土及其它物质。
形态分类
毛燕的名称是由于燕窝采摘后，未经过加工或处理，呈现出夹杂一些燕毛的形态而来的。毛燕主要被加工成燕盏、燕条和燕角。而草燕主要以尼龙草为主，可食用部分的燕窝多有杂质，口感粗糙。草燕主要被加工成燕碎、燕饼等。